Белки SARS CoV-2 представляют собой молекулы с массой от нескольких десятков до нескольких тысяч аминокислотных остатков. Существуют структурные и неструктурные белки. К первым относятся шиповый гликопротеин, или S-белок (S), малый мембранный оболочечный белок (E), мембранный белок (M) и нуклеопротеин или нуклеокапсид (N). Вторая группа состоит из 16 неструктурных белков (Nsp1-16, включая полипротеины репликазы RPP 1a и 1ab) и 10 вспомогательных факторов или белков открытой рамки считывания (ORF3a, 3b, 6, 7a, 7b, 8, 9b, 9c, 10 и 14). Белки S, E и M, расположенные снаружи и в мембране вириона, участвуют в контакте вириона с клеткой и проникновении в нее. Другие белки участвуют в захвате внутриклеточных механизмов и их использовании в собственных интересах вируса. Большинство этих белков содержат многочисленные мотивы, гомологичные человеческим белкам, в том числе таким важным, как интерлейкин-7. Возможно, эта гомология является важным фактором, позволяющим «обмануть» иммунную систему на начальных стадиях инфекции и спровоцировать аутоиммунный ответ впоследствии. Гомология белков SARS CoV-2, с одной стороны, и белков вкусовых и обонятельных рецепторов — с другой, возможно, объясняет причины нарушения восприятия вкусовых и обонятельных раздражителей, характерного для COVID-инфекции.
В настоящем учебном пособии представлены основные понятия о врожденном и адаптивном иммунитете. Описан механизм иммунной защиты от бактериальных инфекций. Подробно разобраны причины развития трех первичных иммунодефицитов: гипер-IgM-синдрома, тяжелого комбинированного иммунодефицита и синдрома «голых» лимфоцитов. Дана характеристика фундаментальных механизмов функционирования иммунной системы, которые нарушаются вследствие перечисленных выше иммунодефицитных состояний. Описаны клинические проявления перечисленных синдромов. Пособие предназначено для студентов, обучающихся по направлению подготовки бакалавров «Биология» (направленность «микробиология и иммунология» и «генетика»).